Programa: Programa de Pós-graduação em: biociências e biotecnologia aplicadas á farmácia autor do trabalho



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PROGRAMA: Programa de Pós-graduação em:
BIOCIÊNCIAS E BIOTECNOLOGIA APLICADAS Á FARMÁCIA
AUTOR DO TRABALHO: ADOLFO CARLOS BARRETO SANTOS
TÍTULO: "GENOTIPAGEM DE ISOLADOS DE Mycobacterium tuberculosis PROVENIENTES DE COMUNIDADES INDÍGENAS E NÃO INDÍGENAS DO MATO GROSSO DO SUL (MS)”

CURSO: DOUTORADO

DATA DA DEFESA: 17/09/2012



ORIENTADOR: Profa.Dra. CLARICE QUEICO FUJIMURA LEITE
ÁREA DE CONHECIMENTO: MICROBIOLOGIA
RESUMO: A TB é uma doença infecciosa que acomete proporção significativa da população mundial e se constitui num importante problema de saúde pública, particularmente nos países em desenvolvimento. O caráter endêmico da doença tem sido mantido por décadas devido a fatores relacionados ao vírus da imunodeficiência humana (HIV), ao grande contingente de indivíduos atingidos pela pobreza e ao mau gerenciamento dos programas de controle da TB possibilitando o aumento nos casos de TB MDR e XDR. No Brasil, em 2010 foram notificados cerca de 70mil novos casos de TB e 4,8 mil mortes em decorrência da doença. Na população indígena a incidência de TB no ano de 2003 alcançou a taxa de 108/100.000 habitantes superando a incidência nacional que está em torno de 38/100.000. Ferramentas de biologia molecular aliadas a epidemiologia clássica, oferecem apoio no controle de surtos de TB, identificando cepas com alto poder de virulência. Assim, técnicas de epidemiologia molecular como MIRU-VNTR, Spoligotyping e RDRio foram aplicadas em 149 isolados de M. tuberculosis provenientes de 17 cidades do estado do Mato Grosso do Sul. No total, 57% eram de pacientes indígenas e 43% de pacientes não indígenas. Do total 58,4% tinham idade entre 21 e 40 anos. Dos 149 isolados avaliados pela técnica de Spoligotyping, 125 foram agrupados em 19 clusters e apenas 24 apresentaram perfis únicos. Verificou-se a predominância da família LAM em 65,77% do total dos casos onde LAM 9 compreendeu 82,65% dos isolados. O SIT 42 (LAM9) foi o mais frequente seguidos do SIT177 (LAM9). Porém as famílias T, S, H e X também foram descritas neste trabalho. Destaca-se a presença de um novo genótipo (SIT 3419) e outro foi descrito anteriormente somente no Brasil (SIT 3422). Os isolados da família LAM foram avaliados quanto a deleção RDRio e 45,9% apresentaram tal perfil de virulência. Em relação ao MIRU-VNTR 12-loci, a linhagem MIT25 foi a mais incidente com 24 isolados. Esta técnica deu origem a 14 grupos genéticos e compreendeu 59 isolados. Estes foram submetidos a genotipagem pelo MIRU-VNTR 24 loci com reagrupamento de 12 grupos com 100% de similaridade. Pela associação dos perfis de Spoligotyping e MIRU-VNTR tornou possível identificar genótipos (SIT42 e MIT25) altamente transmissíveis adaptados as condições do estado do Mato Grosso do Sul. Estes genótipos estão presentes nas comunidades indígenas e não indígenas indicando uma relação de convívio e transmissão entre as populações em questão. O indígena, cada vez mais próximo do homem branco, se contamina e leva a TB para sua comunidade, disseminando o bacilo dentro da comunidade. Portanto é imprescindível a contínua investigação de surtos nessas duas comunidades a fim de controlar a TB no Mato Grosso do Sul.
ABSTRACT: Tuberculosis is an infectious disease that affects a significant proportion of the world population and constitutes an important public health problem, particularly in developing countries. The endemic nature of the disease preserved for decades it's due to some factors related to human immunodeficiency virus (HIV), the large number of individuals affected by poverty and poor management of TB control programs, allowing for the increase in cases of TB MDR and XDR. In Brazil, in 2010 have been notified about 70 thousand new TB cases and 4.8 million deaths from the disease. In the indigenous population the incidence of TB in 2003 reached the rate 108/100.000 inhabitants surpassing the national rate which is around 38/100.000. Molecular biology tools coupled with classical epidemiology, offer support to control TB outbreaks, identifying strains with high virulence. Thus, molecular epidemiology techniques as MIRU-VNTR, Spoligotyping and RDRio were applied in 149 isolates of M. tuberculosis from 17 cities in the state of Mato Grosso do Sul. In total, 57% of patients were indigenous and 43% of non-indigenous patients. Of the total, 58.4% were aged between 21 and 40 years. Of 149 isolates evaluated by Spoligotyping, 125 were grouped in 19 clusters and only 24 showed orphans’ profiles. There was a predominance of LAM family in 65.77% of all cases, where LAM 9 comprised 82.65% of the isolates. The SIT 42 (LAM9) was the most frequent followed by SIT177 (LAM9). However families T, S, H and X have also been described. Noteworthy is the presence of a new profile (SIT3419) and one previously described only in Brazil (SIT3422). The LAM family isolates underwent technique for detection of deletion RDRio and 45.9% had such a virulent profile. Regarding the MIRU-VNTR 12-loci, lineage MIT25 was the most incident with 24 isolates. This technique led to 14 genetic groups and included 59 isolates. These underwent genotyping at MIRU-VNTR 24 loci with regrouping of 12 groups with 100% similarity. By the association of profiles of Spoligotyping and MIRU-VNTR it was possible to identify genotypes (SIT42 and MIT25) highly adapted to Mato Grosso do Sul state environmental conditions. Both lineages are present in indigenous and non-indigenous communities indicating a relationship of familiarity and transmission among populations in question. Indigenous man increasingly close to the white man becomes contaminated and spreads the TB bacillus among his community. Therefore it is essential to investigate the ongoing outbreak in these two communities to control TB in Mato Grosso do Sul.
BANCA EXAMINADORA

TITULARES:

CLARICE QUEICO FUJIMURA LEITE (Orientadora)

JOSE RODRIGO CLÁUDIO PANDOLFI

MARIA HELENA FERES SAAD

ROSILENE FRESSATTI CARDOSO

ELIANA APARECIDA VARANDA



SUPLENTES:

DAISY NAKAMURA SATO



ANDRÉ PITONDO DA SILVA

ADRIANO MONDINI


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